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2IP - Plateforme d'imagerie

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Bactéries (rouge et vert) au sein d'un macrophage (cyan). Image confocale acquise en super-résolution. Scan de lame entière - Axioscan.z1 (ZEISS) Coupe au sein d'un sphéroïde tumoral illustrant la localisation (centrale ou périphérique) des cellules tumorales en fonction de leur statut métabolique (vert: GLUT1; rouge: MCT4). Imagerie par microscopie à feuillet de lumière. Scan de coupe entière de poumon de souris en fond clair. Encart: zoom sur une métastase tumorale dont les cellules tumorales et immunitaires ont été mises en évidence par immunofluorescence. Vue 3D d'un vaisseau sanguin imagé par microscopie à feuillet de lumière.

Expertises techniques et scientifiques

  • Préparation d’échantillons biologiques (sections paraffine et congelées, colorations histologiques et immunomarquages, y compris multiplex TSA) ;
  • Acquisition d'images (imagerie sur lame entière, microscopie à fluorescence 2D et 3D)
  • Analyse d'images (images 2D et 3D, images de lames entières en 2D)

Equipements principaux

  • 3 microtomes (Microm HM340E, avec STS and Coolcut), 1 cryostat (Leica CM1950), 1 autostainer IHC (Leica Bond RXm) et 1 colleuse (Sakura) ;
  • 2 scanners de lames haut débit à fond clair (Leica SCN400 et 3DHistech ScanII) ;
  • 1 scanner de lames haut débit à fluorescence, fond clair & lumière polarisée configuré pour l'imagerie multiplex (7 couleurs) (Zeiss Axioscan.z1) ;
  • 1 microscope confocal inverse équipé de 4 lasers, VSDs, 2 détecteurs GaAsp et 1 détecteur Airyscan, permettant d'imager des échantillons fixés ou vivants (Zeiss LSM800) ;
  • 1 microscope droit à fluorescence (4 couleurs) équipé d'un module ApoTome (Zeiss AxioImager.z1/ApoTome1) ;
  • 1 microscope à feuillet de lumière, équipé de 4 lasers et de 2 caméras, permettant l'imagerie 3D d'échantillons fluorescents fixés/transparisés ou vivants (Zeiss Lightsheet.z1) ;
  • Logiciels: Visiopharm Author, Indicalabs Halo, Arivis4D, Imaris, ZEN blue, ImageJ/Fiji, QuPath

Applications

  • Scan de lames entières
  • Microscopie à fluorescence 2D et 3D
  • Microscopie à lumière polarisée

Services proposés

  • En interne aux étudiantes, étudiants, chercheuses, chercheurs, cliniciennes et cliniciens de l'UCLouvain
  • A l'extérieur

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